Werner ist der Sohn von Edith, Filialleiterin des M-Preis in Matrei i. O., und Albert Rainer, Diplom-Pädagoge an der HTL Lienz. Er hat noch einen jüngeren Bruder Gabriel, der die Hauptschule Matrei besucht. Werner schloss sein Studium Wirtschaft & Management am Management Center Innsbruck mit den Schwerpunkten Personal & Organisationsentwicklung im Oktober 2011 ab. Seine Diplomarbeit befasste sich mit dem Thema „Talent Management – ein Instrument der strategischen Personalentwicklung: Evaluation eines Talent-Management-Prozesses und Vergleiche beim Bindungsgrad von Nachwuchskräften am Beispiel der Innsbrucker Kommunalbetriebe Aktiengesellschaft“, in der er beruflich tätig ist.