Stefan ist der Sohn von Anna und Josef Ebner. Er ist mit Mathilde Ebner-Pichler verheiratet und hat drei Kinder: Martin (23), Manuel (17) und Sabrina (14). In seiner Dissertation verfolgte er das Ziel, informelle Lernsequenzen in den Pausen formeller Unterrichtsettings zu identifizieren. Das Doktoratsstudium schloss er mit Auszeichnung ab. Dr. Ebner ist Lehrer an der Gesundheits- und Krankenpflegeschule Lienz, nebenberuflich unterrichtet er an der FH Kärnten.